Vedecké softvéry umožňujúce pokročilé spracovanie biologických údajov
Predmetom zákazky je nákup vedeckých softvérov (balíka nástrojov) umožňujúcich pokročilé spracovanie biologických údajov vrátane dodania, inštalácie a zaškolenia verejného obstarávateľa na používanie špecializovaných softvérových produktov pre potreby verejného obstarávateľa v oblasti genetiky, štatistiky, sekvenovania a analýzy dát. Programy uľahčia vykonávanie komplexných bioinformatických analýz, ako aj vizualizáciu a interpretáciu ich výsledkov. Súčasťou balíka sú univerzálne softvérové programy založené na serverovej architektúre, podporené o špecifické nástroje, slúžiace na podrobnejšie spracovanie kritických častí analýz. Softvéry sú orientované najmä na spacovanie dát zo sekvenátorov novej generácie.
Špecializované softvérové produkty musia poskytovať nástroje a služby pre nasledovné oblasti:
1. analýza genomických dát:
a) možnosť mapovania čítaní k referencii;
b) skladanie sekvencií bez referencie
c) celogenomická detekciu SNP polymorfov a štruktúrnych variantov;
d) aplikácia ChIP-seq;
e) sekvenovanie malých regulačných RNA;
2. pokročilá analýza RNA-Seq analýz:
a) terciálna analýzy dát;
b) analýza transkriptómu;
c) porovnanie génovej expresie;
d) hľadanie neznámych exprimovaných génov;
3. interpretáciu NGS dát:
a) interpretácia NGS dát v kontexte poznatkov o biochemických dráhach a sieťach organizmov.
Vedecké softvéry musia umožňovať vzájomnú kompatibilitu a možnosť vzájomnej integrácie a výmeny dát, pričom táto výmena dát musí prebiehať v automatizovanom režime a v štandardných dátových formátoch. Dodávané softvérové produkty musia ponúkať možnosť inštalácie v DataCentre verejného obstarávateľa a podporovať architektúru klient-server, pričom je na strane klienta umožnené pracovať v tenkom klientovi.
Súčasťou predmetu zákazky je aj implementácia softvéru, základné predvedenie a zaškolenie softvérových produktov vrátane rozšírenej záruky na 4 roky s nárokom aj na bezplatné uvoľnené nové verzie daného špecializovaného produktu počas rozšírenej záručnej doby.
Termín
Lehota na predkladanie ponúk bola 2014-01-13.
Verejné obstarávanie bolo zverejnené na 2013-12-09.
Dodávatelia
V rozhodnutiach o udelení zákazky alebo v iných dokumentoch o verejnom obstarávaní sú uvedení títo dodávatelia:
Kto?
Čo?
Kde?
História obstarávania
| Dátum |
Dokument |
| 2013-12-09
|
Oznámenie o vyhlásení verejného obstarávania
|
| 2014-04-25
|
Oznámenia o zadaní zákazky
|