Výskum programu onkogénu miR-155 pre potreby diagnózy a určenia prognózy pri onkologických ochoreniach – zmluvný výskum

Množstvo alebo rozsah

Služby:1. zmluvný výskum - microarrays analýza, Microarray aplikácia ChiP-on-chip technológia presahuje tradičné metódy génovej expresie,skúma transkripčné aktivity ako je aktivácia a represia génov. Zisťuje presnú lokalizáciu väzby regulačného proteínu na genomickú DNA a hlbšie pochopenie väzby DNA-proteín a výskyt promotorov v celom genóme;2. zmluvný výskum - next generation sequencing, Sekvenčná analýza DNA (RNA) je metóda, ktorá stanoví primárnu štruktúru nukleových kyselín tj. poradie báz vo vlákne DNA. Genomická éra 90-ich rokov bola postavená na sekvenovaní DNA pomocou gélovej elektroforézy, neskoršie bolo nahradené plne automatizovanými sekvenátormi na báze kapilárnej elektroforézy;3. zmluvný výskum - real time analýza, Metóda je založená na klasickom PCR (polymerázová reťazová reakcia) s tým rozdielom, že špeciálny prístroj umožňuje kontinuálne monitorovat príbytok DNA behom každého cyklu (klasická PCR detekuje finálny produkt). Základnou podmienkou je prítomnosť fluorescenčného substrátu, ktorý sa viaže na syntetizovanú DNA a úroveň detegovanej fluorescencie potom sa odráža množstvom nasyntetizovanej nukleovej kyseliny. Dáta sú zbierané behom celého PCR procesu na špeciálnych "termocykléroch" s optikou, umožňujúce excitáciu substrátu a následnú detekciu fluorescencie;4. zmluvný výskum - nezávislé testovanie súprav, V konečnej fáze výskumu po vytvorení súboru potenciálne prediktívnych génov a vytvorení vzorca interpretácie merania využiteľného pre klinické hodnotenia v bežnej medicínskej praxi sa má zostaviť a testovať kit pre klinické použitie a ochrániť toto duševné vlastníctvo napr. úžitným vzorom (povinne) či patentom (neplánovane). Zostavenie a testovanie kitu musí uskutočniť spoločnosť nezaujatá, disponujúca s odbornými vedomosťami a všetkým technickým vybavením pre vyhodnotenie testovaného kitu;5. zmluvný výskum - data analýza, Technológia DNA microarray sa stala moderným nástrojom pre získavanie profilov génovej expresie v takmer každej oblasti biomedicínskeho výskumu.Každá analýza microarray dát sa stretáva s niekoľkými problémami. Problémom je už základná výhoda microarray experimentu. Vysoký počet sledovaných premenných pri malom počte pozorovaní vyžaduje zvláštne analytické metódy. Navyše microarray dáta bývajú zaťažené šumom. V skutočnosti takmer každá fáza microarray experimentu (príprava mRNA, transkripcia, farbenie, amplifikácia, prenos cDNA na sklíčko, hybridizácia, skenovanie) je zdrojom šumu. Preto aj pri dôslednom zopakovaní microarray experimentu s rovnakým materiálom za rovnakých podmienok je veľmi pravdepodobné, že sa získajú rozdielne hodnoty hladín expresie. Počas hodnotenia kvality naskenovaného sklíčka sa z ďalšej analýzy vylučujú podozrivé oblasti, čím vznikajú v dátach chýbajúce hodnoty. Kvôli týmto vlastnostiam microarray dát sú výsledky jednotlivých microarray štúdií často veľmi rozdielne. Z takýchto rozdielnych výsledkov je náročné vyvodzovať všeobecne platné závery, ktoré by mohli byť priamo aplikované do praxe, obzvlášť ak ide o medicínske aplikácie. Preto je potrebné dostupné publikované výsledky zjednotiť použitím metód meta-analýzy;6. zmluvný výskum - analýza bunkových kultúr, Prvým krokom vo výskume je selekcia vhodných buniek na analýzu. Proces predstavujú náročné a citlivé techniky (izolácia a farbenie buniek, určovanie viability, separácia buniek, kultivácia bunkových línií atď.), ktoré potrebujú špecialistu s dlhoročnými skúsenosťami s prácou s bunkovými kultúrami. Na takúto problematiku sú potrebné špecializované rôzne laboratóriá, ktoré zabezpečia vysoký štandard služieb analýz bunkových kultúr;7. zmluvný výskum - výroba protilátok, Značná časť projektu sa venuje analýze komplexov DNA-proteín, tieto komplexy je možné z bunkových lyzátov vychytať pomocou techniky imunoprecipitácia protilátkou uchytenou na špeciálnych nosičoch (napr. proteín A a G-sefaróza, eventuálne magnetická častica). Monoklonálnu alebo poliklonálnu protilátku je potrebné vyrobiť, čo je veľmi zložitý a náročný proces. Príprava monoklonálnych protilátok predstavuje ucelený technologický postup pozostávajúci z celého radu nadväzujúcich krokov: imunizácia, odobratie sleziny a príprava na fúziu, aktivácia myelómových buniek pre fúziu, fúzia rodičovských buniek, selekcia dcérskych hybridómov, klonovanie a kultivácia hybridómov, testovanie hybridómov na produkciu špecifických protilátok, produkcia monoklonálnych protilátok.800 000,00

Ekonomická a finančná situácia

V súlade s § 27 ods. 1 písm. a) - vyjadrenie banky alebo pobočky zahraničnej banky, ktoré obsahuje potvrdenie banky o tom, že záujemca nebol za obdobie roku 2011 v nepovolenom debete, v prípade splácania úveru dodržuje splátkový kalendár, jeho bankový účet (účty) nebol predmetom exekúcie.

Minimálna úroveň (úrovne) štandardov

Všetky požadované doklady a dokumenty musia byť predložené ako originály, alebo úradne osvedčené kópie nie staršie ako 3 mesiace. Obstarávateľ vylúči z verejného obstarávania uchádzača, ak nesplnil podmienky účasti, predložil neplatné doklady, nepredložil požadované doklady alebo informácie, poskytol nepravdivé alebo skreslené informácie.

Hlavné podmienky financovania a platobné dojednania a/alebo odkaz na príslušné ustanovenia, ktoré ich upravujú

Predmet obstarávania bude financovaný v rámci výzvy: 2620002 OP Výskum a vývoj, Prioritná os 4 - Podpora výskumu a vývoja v BK, 4.2 Prenos poznatkov a technológií získaných výskumom a vývojom do praxe v Bratislavskom kraji, OPVaV-2011/4.2/07-SORO. Obstarávateľ neposkytuje zálohy ani preddavky. Financovanie sa bude vykonávať formou bezhotovostného platobného styku na základe daňových dokladov - faktúr za každé v zmluve stanovené plnenie predmetu zákazky. Splatnosť faktúr (predpoklad 100 dní) bude upravená v návrhu zmluvy na zabezpečenie dodávok tovarov, prác a služieb, ktorá je súčasťou súťažných podkladov.

Právna forma, ktorú má mať skupina hospodárskych subjektov, ktorej sa má zákazka zadať

V prípade prijatia ponuky skupiny dodávateľov obstarávateľ vyžaduje v súlade s § 31 ods. 2 zákona o verejnom obstarávaní, aby skupina pred podpisom Rámcovej dohody vytvorila právne vzťahy, potrebné z dôvodu riadneho plnenia predmetu zákazky, napr. vytvorila združenie bez právnej subjektivity podľa § 829 Občianskeho zákonníka, niektorú z obchodných spoločností podľa Obchodného zákonníka, alebo iný právny vzťah vhodný na riadne plnenie predmetu zákazky. Úspešný uchádzač preukazuje vyššie uvedené skutočnosti napr. v prípade obchodných spoločností podľa Obchodného zákonníka výpisom z Obchodného registra, v prípade konzorcia postačuje predložiť platnú a účinnú zmluvu o združení podľa § 829 Občianskeho zákonníka.

Informácie o oprávnených osobách a otváraní ponúk

Na otváraní obálok s ponukami sa môžu zúčastniť oprávnení zástupcovia uchádzača. Na otváraní obálok s ponukami môže byť uchádzač zastúpený štatutárnym orgánom alebo členom štatutárneho orgánu uchádzača alebo osobou splnomocnenou uchádzačom na jeho zastupovanie. Uchádzač (fyzická osoba), štatutárny orgán alebo člen štatutárneho orgánu uchádzača (právnická osoba), sa preukáže na otváraní obálok s ponukami preukazom totožnosti a kópiou dokladu o oprávnení podnikať. Poverený zástupca uchádzača sa preukáže preukazom totožnosti a splnomocnením na zastupovanie.